解析情報 ゲノム

データID ANGE0000000003994
データタイトル ゲノム(Acetobacter nitrogenifigens DSM 23921 = NBRC 105050 strain DSM 23921, whole genome shotgun sequencing project)
生物種名 Acetobacter nitrogenifigens DSM 23921 = NBRC 105050
アクセッション番号またはID AUBI00000000
コメント Acetobacter nitrogenifigens DSM 23921 = NBRC 105050 strain DSM 23921, whole genome shotgun sequencing project.
ゲノム配列のバージョン AUBI00000000.1
登録日または更新日 2013-07-15
配列取得用URL
配列ファイルダウンロード
配列長(bp)または配列数(rc) 52
形態 linear
BioProject
BioSample
配列の種類 genomic DNA
strain DSM 23921
分離源
plasmid
備考
菌株へのコメント The Acetobacter nitrogenifigens DSM 23921 = NBRC 105050 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession AUBI00000000. This version of the project (01) has the accession number AUBI01000000, and consists of sequences AUBI01000001-AUBI01000052.; URL -- http://www.jgi.doe.gov~JGI Project ID: 1008523~Source DNA and organism available from Hans-Peter Klenk at the German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ) (hans-peter.klenk@dsmz.de)~Contacts: Nikos Kyrpides (nckyrpides@lbl.gov)~ Tanja Woyke (microbe@cuba.jgi-psf.org)~Whole genome sequencing and draft assembly at JGI~Annotation by JGI~The JGI and collaborators endorse the principles for the distribution and use of large scale sequencing data adopted by the larger genome sequencing community and urge users of this data to follow them. It is our intention to publish the work of this project in a timely fashion and we welcome collaborative interaction on the project and analysis.~(http://www.genome.gov/page.cfm?pageID=10506376)~Full annotations are available from IMG.; ##MIGS-Data-START## ; country :: India ; investigation_type :: bacteria_archaea ; project_name :: Acetobacter nitrogenifigens DSM 23921 ; sequencing_meth :: WGS ; ref_biomaterial :: DSM 23921 ; finishing_strategy :: Level 1: Standard Draft ; GOLD Stamp ID :: Gi11063 ; Type Strain :: Yes ; Funding Program :: DOE-CSP 2012 ; Isolation Site :: Kombucha tea ; Gram Staining :: Gram- ; ##MIGS-Data-END##; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Finishing Goal :: Improved High-Quality Draft ; Current Finishing Status :: Improved High-Quality Draft ; Assembly Method :: Unknown program v. before 2013-03-06 ; Genome Coverage :: Unknown ; Sequencing Technology :: Illumina HiSeq 2000 ; ##Genome-Assembly-Data-END##
参照 1
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (02-JUL-2013) DOE Joint Genome Institute, 2800 Mitchell Drive, Walnut Creek, CA 94598-1698, USA
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Kyrpides,N. Huntemann,M. Han,J. Chen,A. Mavromatis,K. Markowitz,V. Palaniappan,K. Ivanova,N. Schaumberg,A. Pati,A. Liolios,K. Nordberg,H.P. Cantor,M.N. Hua,S.X. Woyke,T.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ

1.微生物株情報  1件

2.微生物種情報  1件

5.文献情報  0件

Not found

7.コレクション情報  1件

8.提供機関情報  1件

9.実験情報  0件

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10.プロジェクト情報  0件

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