解析情報 ゲノム

データID
ANGE0000000004012
データタイトル
ゲノム(Galdieria partita strain NBRC 102759 isolate haploid clone N1, whole genome shotgun sequencing project)
生物種名
Galdieria partita
アクセッション番号またはID
BQMJ00000000
コメント
Galdieria partita strain NBRC 102759 isolate haploid clone N1, whole genome shotgun sequencing project.
ゲノム配列のバージョン
BQMJ00000000.1
登録日または更新日
2022-09-28
配列取得用URL
配列ファイルダウンロード
配列長(bp)または配列数(rc)
80
形態
linear
BioProject
BioSample
配列の種類
genomic DNA
strain
NBRC 102759
分離源
plasmid
備考
菌株へのコメント
The Galdieria partita whole genome shotgun (WGS) project has the project accession BQMJ00000000. This version of the project (01) has the accession number BQMJ01000000, and consists of sequences BQMJ01000001-BQMJ01000080.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Canu v. 2.0; Racon v. 1.4.17; Pilon v. 1.2.3 ; Assembly Name :: GpartN1_1.0 ; Genome Coverage :: 800x ; Sequencing Technology :: PacBio Sequel; Illumina NovaSeq 6000 ; ##Genome-Assembly-Data-END##
参照
1
  タイトル
Life cycle and functional genomics of the unicellular red alga Galdieria for elucidating algal and plant evolution and industrial use
  雑誌名/登録機関名
Proc Natl Acad Sci U S A 119 (41), e2210665119 (2022)
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者
Hirooka,S. Itabashi,T. Ichinose,T.M. Onuma,R. Fujiwara,T. Yamashita,S. Jong,L.W. Tomita,R. Iwane,A.H. Miyagishima,S.Y.
  PubMed
参照
2
  タイトル
Direct Submission
  雑誌名/登録機関名
Submitted (20-JAN-2022) Contact:Shunsuke Hirooka National Institute of Genetics, Department of Gene Function and Phenomics; Yata 1111, Mishima, Shizuoka 411-8540, Japan
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者
Hirooka,S. Miyagishima,S.Y.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 0 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ
1.微生物株情報 1件
2.微生物種情報 0件

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5.文献情報 0件

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7.コレクション情報 1件
8.提供機関情報 1件
9.実験情報 0件

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10.プロジェクト情報 0件

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