解析情報 ゲノム

データID ANGE0000000004014
データタイトル ゲノム(Philodulcilactobacillus myokoensis strain WR16-4, whole genome shotgun sequencing project)
生物種名 Philodulcilactobacillus myokoensis
アクセッション番号またはID BRPL00000000
コメント Philodulcilactobacillus myokoensis strain WR16-4, whole genome shotgun sequencing project.
ゲノム配列のバージョン BRPL00000000.1
登録日または更新日 2022-11-22
配列取得用URL
配列ファイルダウンロード
配列長(bp)または配列数(rc) 4
形態 linear
BioProject
BioSample
配列の種類 genomic DNA
strain WR16-4
分離源 fermented vegetable extract
plasmid
備考
菌株へのコメント The Philodulcilactobacillus myokoensis whole genome shotgun (WGS) project has the project accession BRPL00000000. This version of the project (01) has the accession number BRPL01000000, and consists of sequences BRPL01000001-BRPL01000004.; Annotated by DFAST https://dfast.ddbj.nig.ac.jp/~~; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SMRT Link v. 10.1.0.119528; Filtlong v. 2.0; Flye v. 2.9; Bandage v. 0.8.1; CheckM v. 1.1.2 ; Genome Coverage :: 125X ; Sequencing Technology :: PacBio Sequel IIe ; ##Genome-Assembly-Data-END##
参照 1
  タイトル Philodulcilactobacillus myokoensis gen. nov., sp. nov., a fructophilic, acidophilic, and agar-phobic lactic acid bacterium isolated from fermented vegetable extracts
  雑誌名/登録機関名 PLoS One 18 (6), e0286677 (2023)
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Kouya,T. Ishiyama,Y. Ohashi,S. Kumakubo,R. Yamazaki,T. Otaki,T.
  PubMed
参照 2
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (11-JUL-2022) Contact:Tomoaki Kouya National Institute of Technology, Oyama College, Department of Materials Chemistry and Bioengineering; 771 Ohaza-Nakakuki, Oyama, Tochigi 323-0806, Japan URL :https://www.oyama-ct.ac.jp/
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Kouya,T. Ishiyama,Y.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ

1.微生物株情報  1件

2.微生物種情報  1件

5.文献情報  0件

Not found

7.コレクション情報  1件

8.提供機関情報  1件

9.実験情報  0件

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10.プロジェクト情報  0件

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