| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004073 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Apilactobacillus apisilvae strain SG5_A10 plasmid p2unnamed, complete sequence） |
| 生物種名 | Apilactobacillus apisilvae |
| アクセッション番号またはID | CP093364 |
| コメント | Apilactobacillus apisilvae strain SG5_A10 plasmid p2unnamed, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | CP093364.1 |
| 登録日または更新日 | 2022-05-17 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 38616 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | SG5_A10 |
| 分離源 | Bee |
| plasmid | p2unnamed |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: NOV-2020 ; Assembly Method :: Smrtlink v. 9.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 11482x ; Sequencing Technology :: PacBio Sequel II ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 03/14/2022 11:52:50 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.0 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 1,575 ; CDSs (total) :: 1,494 ; Genes (coding) :: 1,480 ; CDSs (with protein) :: 1,480 ; Genes (RNA) :: 81 ; rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 5, 5, 5 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 63 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 14 ; CDSs (without protein) :: 14 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 14 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 5 of 14 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 11 of 14 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 1 of 14 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 3 of 14 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Apilactobacillus apisilvae sp. nov., Nicolia spurrieriana gen. nov. sp. nov., Bombilactobacillus folatiphilus sp. nov. and Bombilactobacillus thymidiniphilus sp. nov., four new lactic acid bacterial isolates from stingless bees Tetragonula carbonaria and Austroplebeia australis |
| 雑誌名/登録機関名 | Int J Syst Evol Microbiol 72 (9) (2022) |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Oliphant,S.A. Watson-Haigh,N.S. Sumby,K.M. Gardner,J. Groom,S. Jiranek,V. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (11-MAR-2022) Wine Science, The University of Adelaide, PMB 1, Glen Osmond, South Australia 5064, Australia |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Oliphant,S.A. Sumby,K.M. Gardner,J.M. Watson-Haigh,N.S. Jiranek,V. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
Not found
7.コレクション情報
8.提供機関情報
9.実験情報
Not found
10.プロジェクト情報
Not found
