解析情報 ゲノム

データID ANGE0000000004075
データタイトル ゲノム(Bombilactobacillus folatiphilus strain SG4_D2 chromosome, complete genome)
生物種名 Bombilactobacillus folatiphilus
アクセッション番号またはID CP093366
コメント Bombilactobacillus folatiphilus strain SG4_D2 chromosome, complete genome.
ゲノム配列のバージョン CP093366.1
登録日または更新日 2022-05-17
配列取得用URL
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配列長(bp)または配列数(rc) 1622785
形態 circular
BioProject
BioSample
配列の種類 genomic DNA
strain SG4_D2
分離源 Bee
plasmid
備考
菌株へのコメント The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: NOV-2020 ; Assembly Method :: Smrtlink v. 9.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 7404x ; Sequencing Technology :: PacBio Sequel II ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 03/14/2022 11:45:56 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.0 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 1,623 ; CDSs (total) :: 1,550 ; Genes (coding) :: 1,527 ; CDSs (with protein) :: 1,527 ; Genes (RNA) :: 73 ; rRNAs :: 4, 4, 4 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 4, 4, 4 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 58 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 23 ; CDSs (without protein) :: 23 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 23 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 12 of 23 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 9 of 23 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 10 of 23 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 7 of 23 ; CRISPR Arrays :: 3 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
参照 1
  タイトル Apilactobacillus apisilvae sp. nov., Nicolia spurrieriana gen. nov. sp. nov., Bombilactobacillus folatiphilus sp. nov. and Bombilactobacillus thymidiniphilus sp. nov., four new lactic acid bacterial isolates from stingless bees Tetragonula carbonaria and Austroplebeia australis
  雑誌名/登録機関名 Int J Syst Evol Microbiol 72 (9) (2022)
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Oliphant,S.A. Watson-Haigh,N.S. Sumby,K.M. Gardner,J. Groom,S. Jiranek,V.
  PubMed
参照 2
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (11-MAR-2022) Wine Science, The University of Adelaide, PMB 1, Glen Osmond, South Australia 5064, Australia
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Oliphant,S.A. Sumby,K.M. Gardner,J.M. Watson-Haigh,N.S. Jiranek,V.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ

1.微生物株情報  1件

2.微生物種情報  1件

5.文献情報  0件

Not found

7.コレクション情報  1件

8.提供機関情報  1件

9.実験情報  0件

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10.プロジェクト情報  0件

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