解析情報 ゲノム

データID ANGE0000000004077
データタイトル ゲノム(Agromyces larvae strain CFWR-12 chromosome, complete genome)
生物種名 Agromyces larvae
アクセッション番号またはID CP094528
コメント Agromyces larvae strain CFWR-12 chromosome, complete genome.
ゲノム配列のバージョン CP094528.1
登録日または更新日 2022-04-04
配列取得用URL
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配列長(bp)または配列数(rc) 4005264
形態 circular
BioProject
BioSample
配列の種類 genomic DNA
strain CFWR-12
分離源 Gut of Protaetia brevitarsis seulensis larvae
plasmid
備考
菌株へのコメント Bacteria and source DNA available from Korean Agricultural Culture Collection (KACC).; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: DEC-2021 ; Assembly Method :: NextDenovo v. 2.5.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 149.1x ; Sequencing Technology :: Pilon ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 03/29/2022 13:53:43 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.1 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 3,804 ; CDSs (total) :: 3,747 ; Genes (coding) :: 3,705 ; CDSs (with protein) :: 3,705 ; Genes (RNA) :: 57 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 48 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 42 ; CDSs (without protein) :: 42 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 42 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 14 of 42 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 35 of 42 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 4 of 42 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 8 of 42 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
参照 1
  タイトル Mucilaginibacter sp. isolated from the gut of Protaetia brevitarsis seulensis larvae
  雑誌名/登録機関名 Unpublished
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Won,M. Kim,S.-J. Kwon,S.-W.
  PubMed
参照 2
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (28-MAR-2022) Agricultural Microbiology Division, National Institute of Agricultural Sciences, 166, Nongsaengmyeong-ro, Iseo-myeon, Wanju-gun, Jeollabuk-do 55365, South Korea
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Won,M. Kim,S.-J. Kwon,S.-W.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ

1.微生物株情報  1件

2.微生物種情報  1件

5.文献情報  0件

Not found

7.コレクション情報  1件

8.提供機関情報  1件

9.実験情報  0件

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10.プロジェクト情報  0件

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