| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004078
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（Leucobacter rhizosphaerae strain H25R-14 chromosome, complete genome）
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| 生物種名 |
Leucobacter rhizosphaerae
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| アクセッション番号またはID |
CP095043
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| コメント |
Leucobacter rhizosphaerae strain H25R-14 chromosome, complete genome.
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| ゲノム配列のバージョン |
CP095043.1
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| 登録日または更新日 |
2022-04-12
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
3337834
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| 形態 |
circular
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
H25R-14
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| 分離源 |
Rhizosphere of onion
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
Bacteria and source DNA available from Korean Agricultural Culture Collection (KACC).; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: MAR-2020 ; Assembly Method :: Canu v. 1.7 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 162.0x ; Sequencing Technology :: PacBio RSII ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 04/05/2022 13:36:57 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.1 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 3,094 ; CDSs (total) :: 3,036 ; Genes (coding) :: 2,996 ; CDSs (with protein) :: 2,996 ; Genes (RNA) :: 58 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 49 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 40 ; CDSs (without protein) :: 40 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 40 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 24 of 40 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 18 of 40 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 1 of 40 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 3 of 40 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Leucobacter sp. isolated from rhizosphere of onion
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Won,M. Lee,C.-M. Woen,H.-Y. Kwon,S.-W.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (04-APR-2022) Agricultural Microbiology Division, National Institute of Agricultural Sciences, 166, Nongsaengmyeong-ro, Iseo-myeon, Wanju-gun, Jeollabuk-do 55365, South Korea
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Won,M. Lee,C.-M. Woen,H.-Y. Kwon,S.-W.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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