| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004089 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Porifericola rhodea strain NBRC 107748 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Porifericola rhodea |
| アクセッション番号またはID | CP119421 |
| コメント | Porifericola rhodea strain NBRC 107748 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | CP119421.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-07-19 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 5487627 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 107748 |
| 分離源 | |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | Bacteria and source DNA available from Xiamen University.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: FALCON v. 0.3 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 297.0x ; Sequencing Technology :: PacBio Sequel ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 03/09/2023 15:21:34 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.4 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,518 ; CDSs (total) :: 4,469 ; Genes (coding) :: 4,450 ; CDSs (with protein) :: 4,450 ; Genes (RNA) :: 49 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 40 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 19 ; CDSs (without protein) :: 19 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 19 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 5 of 19 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 14 of 19 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 4 of 19 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 4 of 19 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Comparative genome analysis |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,B. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (02-MAR-2023) State Key Laboratory for Marine Environmental Science, Institute of Marine Microbes and Ecospheres, Xiamen University, A3-302, Zhoulongquan Building, Xiamen University, Xiamen, Fujian 361102, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,B. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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