| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004095 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Altererythrobacter rubellus strain NBRC 112769 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Altererythrobacter rubellus |
| アクセッション番号またはID | CP127221 |
| コメント | Altererythrobacter rubellus strain NBRC 112769 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | CP127221.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-06-17 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 2296411 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 112769 |
| 分離源 | marine |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Pacbio SMRT v. V6.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 1322.7x ; Sequencing Technology :: PacBio ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 06/11/2023 01:22:01 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 2,296 ; CDSs (total) :: 2,248 ; Genes (coding) :: 2,211 ; CDSs (with protein) :: 2,211 ; Genes (RNA) :: 48 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 42 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 37 ; CDSs (without protein) :: 37 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 37 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 6 of 37 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 23 of 37 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 15 of 37 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 6 of 37 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Altererythrobacter rubellus NBRC 112769 genome |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Zhang,K. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (06-JUN-2023) University of Chinese Academy of Sciences, South China Sea Institute of Oceanology, Xingang Western Road, Guangzhou, Guangdong 510301, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Zhang,K. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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