| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004095
|
|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（Altererythrobacter rubellus strain NBRC 112769 chromosome, complete genome）
|
| 生物種名 |
Altererythrobacter rubellus
|
| アクセッション番号またはID |
CP127221
|
| コメント |
Altererythrobacter rubellus strain NBRC 112769 chromosome, complete genome.
|
| ゲノム配列のバージョン |
CP127221.1
|
| 登録日または更新日 |
2023-06-17
|
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
2296411
|
| 形態 |
circular
|
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
|
| strain |
NBRC 112769
|
| 分離源 |
marine
|
| plasmid |
|
| 備考 |
|
| 菌株へのコメント |
The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Pacbio SMRT v. V6.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 1322.7x ; Sequencing Technology :: PacBio ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 06/11/2023 01:22:01 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 2,296 ; CDSs (total) :: 2,248 ; Genes (coding) :: 2,211 ; CDSs (with protein) :: 2,211 ; Genes (RNA) :: 48 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 42 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 37 ; CDSs (without protein) :: 37 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 37 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 6 of 37 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 23 of 37 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 15 of 37 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 6 of 37 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
|
| 参照 |
1
|
| タイトル |
Altererythrobacter rubellus NBRC 112769 genome
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Zhang,K.
|
| PubMed |
|
| 参照 |
2
|
| タイトル |
Direct Submission
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (06-JUN-2023) University of Chinese Academy of Sciences, South China Sea Institute of Oceanology, Xingang Western Road, Guangzhou, Guangdong 510301, China
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Zhang,K.
|
| PubMed |
|
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
