| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004096
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（Micromonospora sp. NBRC 110009 chromosome unmamed1, complete sequence）
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| 生物種名 |
Micromonospora sp. NBRC 110009
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| アクセッション番号またはID |
CP130427
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| コメント |
Micromonospora sp. NBRC 110009 chromosome unmamed1, complete sequence.
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| ゲノム配列のバージョン |
CP130427.1
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| 登録日または更新日 |
2023-07-23
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
7061565
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| 形態 |
circular
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
NBRC 110009
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| 分離源 |
rhizosphere soil
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
Bacteria and source DNA available from Mo Ping.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SOAPdenovo v. 8.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: No ; Genome Coverage :: 238.67x ; Sequencing Technology :: Oxford Nanopore PromethION ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 07/17/2023 09:02:35 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 6,656 ; CDSs (total) :: 6,586 ; Genes (coding) :: 6,484 ; CDSs (with protein) :: 6,484 ; Genes (RNA) :: 70 ; rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 58 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 102 ; CDSs (without protein) :: 102 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 102 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 24 of 102 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 88 of 102 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 3 of 102 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 102 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Micromonospora soli NBRC 110009
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Mo,P.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (13-JUL-2023) College of Life and Environment Science, Hunan University of Arts and Science, No. 3150 Dongting Avenue, Changde, Hunan 415000, China
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Mo,P.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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