| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004097 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Micromonospora sp. NBRC 110009 plasmid punmamed1, complete sequence） |
| 生物種名 | Micromonospora sp. NBRC 110009 |
| アクセッション番号またはID | CP130428 |
| コメント | Micromonospora sp. NBRC 110009 plasmid punmamed1, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | CP130428.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-07-23 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 6137 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 110009 |
| 分離源 | rhizosphere soil |
| plasmid | punmamed1 |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | Bacteria and source DNA available from Mo Ping.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SOAPdenovo v. 8.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: No ; Genome Coverage :: 238.67x ; Sequencing Technology :: Oxford Nanopore PromethION ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 07/17/2023 09:02:35 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 6,656 ; CDSs (total) :: 6,586 ; Genes (coding) :: 6,484 ; CDSs (with protein) :: 6,484 ; Genes (RNA) :: 70 ; rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 58 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 102 ; CDSs (without protein) :: 102 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 102 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 24 of 102 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 88 of 102 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 3 of 102 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 102 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Micromonospora soli NBRC 110009 |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Mo,P. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (13-JUL-2023) College of Life and Environment Science, Hunan University of Arts and Science, No. 3150 Dongting Avenue, Changde, Hunan 415000, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Mo,P. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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