| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004098 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Edwardsiella piscicida strain NBRC 12716 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Edwardsiella piscicida |
| アクセッション番号またはID | CP131923 |
| コメント | Edwardsiella piscicida strain NBRC 12716 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | CP131923.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-08-09 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3771060 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 12716 |
| 分離源 | liver |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | Bacteria and source DNA available from Japan NITE Biological Resource Center, NBRC12716.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 28-JUL-2023 ; Assembly Method :: Flye v. 2.9.2 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 133.0x ; Sequencing Technology :: Oxford Nanopore MinION ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 08/03/2023 10:35:39 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,482 ; CDSs (total) :: 3,356 ; Genes (coding) :: 3,182 ; CDSs (with protein) :: 3,182 ; Genes (RNA) :: 126 ; rRNAs :: 9, 8, 8 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 9, 8, 8 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 96 ; ncRNAs :: 5 ; Pseudo Genes (total) :: 174 ; CDSs (without protein) :: 174 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 174 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 139 of 174 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 44 of 174 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 5 of 174 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 174 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Complete genome sequence of Edwardsiella sp. NBRC12716 isolated in 1962 from the liver of diseased eel |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Lanza,A. Mizobata,H. Yonezawa,R. Yoshitake,K. Kinoshita,S. Asakawa,S. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (02-AUG-2023) Department of Aquatic Bioscience, The University of Tokyo, Graduate School of Agricultural and Life Sciences, 1 Chome 1-1 Yayoi, Tokyo City 113-8675, Japan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Lanza,A. Mizobata,H. Yonezawa,R. Yoshitake,K. Kinoshita,S. Asakawa,S. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
Not found
7.コレクション情報
8.提供機関情報
9.実験情報
Not found
10.プロジェクト情報
Not found
