| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004099 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Sediminicoccus rosea strain R-30 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Sediminicoccus rosea |
| アクセッション番号またはID | CP137852 |
| コメント | Sediminicoccus rosea strain R-30 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | CP137852.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-11-12 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 5121490 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | R-30 |
| 分離源 | lake sediment |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 31-OCT-2023 ; Assembly Method :: Unicycler v. v. v0.4.9 ; Assembly Name :: MBU_R-30T ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 97.3x ; Sequencing Technology :: Illumina NovaSeq; Oxford Nanopore MinION ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 11/06/2023 10:36:40 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,949 ; CDSs (total) :: 4,892 ; Genes (coding) :: 4,872 ; CDSs (with protein) :: 4,872 ; Genes (RNA) :: 57 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 48 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 20 ; CDSs (without protein) :: 20 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 20 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 6 of 20 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 15 of 20 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 6 of 20 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 6 of 20 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Arctic aerobic anoxygenic photoheterotroph Sediminicoccus rosea KRV36 adapts its photosynthesis to long days of polar summer |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Tomasch,J. Kopejtka,K. Bily,T. Gardiner,A.T. Gardian,Z. Shivaramu,S. Koblizek,M. Engelhardt,F. Kaftan,D. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (02-NOV-2023) Laboratory of Anoxygenic Phototrophs, Institute of Microbiology, CAS, Novohradska 237, Trebon 37901, Czech Republic |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Tomasch,J. Kopejtka,K. Bily,T. Gardiner,A.T. Gardian,Z. Shivaramu,S. Koblizek,M. Engelhardt,F. Kaftan,D. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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