| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004102 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Arachnia propionica strain NBRC 14587 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Arachnia propionica |
| アクセッション番号またはID | CP146373 |
| コメント | Arachnia propionica strain NBRC 14587 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | CP146373.1 |
| 登録日または更新日 | 2024-03-07 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3307556 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 14587 |
| 分離源 | dental plaque |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | Bacteria and source DNA available from extrinsic black tooth stain.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: unicycler v. 0.4.8 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 100.0x ; Sequencing Technology :: PacBio ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 03/01/2024 11:20:22 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,070 ; CDSs (total) :: 3,013 ; Genes (coding) :: 2,986 ; CDSs (with protein) :: 2,986 ; Genes (RNA) :: 57 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 48 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 27 ; CDSs (without protein) :: 27 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 27 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 7 of 27 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 23 of 27 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 5 of 27 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 6 of 27 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Pseudopropionibacterium propionica NBRC 14587, complete genome |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Xue,D. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (28-FEB-2024) Stomatology, Kunming Medical University, No. 1088 Middle Haiyuan Road, Kunming, Yunnan 650000, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Xue,D. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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