| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004129 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Brachybacterium sillae strain EF45031, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Brachybacterium sillae |
| アクセッション番号またはID | JAFEUW000000000 |
| コメント | Brachybacterium sillae strain EF45031, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | JAFEUW000000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2022-09-07 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 2 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | EF45031 |
| 分離源 | hot spring |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | The Brachybacterium sillae whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JAFEUW000000000. This version of the project (01) has the accession number JAFEUW010000000, and consists of sequences JAFEUW010000001-JAFEUW010000002.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from Silla University.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 16-NOV-2020 ; Assembly Method :: HGAP v. 3 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 125.0x ; Sequencing Technology :: PacBio RSII ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 02/11/2021 16:52:44 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.1 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 2,445 ; CDSs (total) :: 2,386 ; Genes (coding) :: 2,263 ; CDSs (with protein) :: 2,263 ; Genes (RNA) :: 59 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 50 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 123 ; CDSs (without protein) :: 123 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 123 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 75 of 123 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 56 of 123 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 9 of 123 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 16 of 123 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Brachybacterium sp. nov isolated from geothermal hot spring in Chungju, Republic of Korea |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Lee,S.-J. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (10-FEB-2021) Food Biotechnology, Silla University, 140 Baegyang-daero 700 Beon-gil Sasang-gu, Busan 46958, South Korea |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Lee,S.-J. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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