| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
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解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004133
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| データタイトル |
ゲノム（Microbacterium allomyrinae strain BWT-G7, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Microbacterium allomyrinae
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| アクセッション番号またはID |
JAGTTN000000000
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| コメント |
Microbacterium allomyrinae strain BWT-G7, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
JAGTTN000000000.1
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| 登録日または更新日 |
2021-10-29
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
18
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
BWT-G7
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| 分離源 |
larvae of insect
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
The Microbacterium allomyrinae whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JAGTTN000000000. This version of the project (01) has the accession number JAGTTN010000000, and consists of sequences JAGTTN010000001-JAGTTN010000018.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SOAPdenovo v. 3.13.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 182.0x ; Sequencing Technology :: Illumina ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 04/26/2021 16:41:06 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.1 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 3,759 ; CDSs (total) :: 3,701 ; Genes (coding) :: 3,668 ; CDSs (with protein) :: 3,668 ; Genes (RNA) :: 58 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 49 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 33 ; CDSs (without protein) :: 33 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 33 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 7 of 33 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 24 of 33 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 2 of 33 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Microbacterium tenobrionis sp. nov. and Microbacterium allomyrinae sp. nov., isolated from larvae of Tenobrio molitor and Allomyrina dichotoma, respectively
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Lee,S.D.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (23-APR-2021) Institute of Jeju Microbial Resources, BioPS Co., Ltd., Sancheondan Dongil 16, Jeju 63243, South Korea
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Lee,S.D.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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