| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004134
|
|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（Kineosporia corallincola strain J2-2, whole genome shotgun sequencing project）
|
| 生物種名 |
Kineosporia corallincola
|
| アクセッション番号またはID |
JAHBAY000000000
|
| コメント |
Kineosporia corallincola strain J2-2, whole genome shotgun sequencing project.
|
| ゲノム配列のバージョン |
JAHBAY000000000.1
|
| 登録日または更新日 |
2021-05-25
|
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
53
|
| 形態 |
linear
|
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
|
| strain |
J2-2
|
| 分離源 |
Island
|
| plasmid |
|
| 備考 |
|
| 菌株へのコメント |
The Kineosporia corallincola whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JAHBAY000000000. This version of the project (01) has the accession number JAHBAY010000000, and consists of sequences JAHBAY010000001-JAHBAY010000053.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPAdes v. 3.12 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 150x ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 05/12/2021 10:06:19 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.2 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 7,135 ; CDSs (total) :: 7,073 ; Genes (coding) :: 7,050 ; CDSs (with protein) :: 7,050 ; Genes (RNA) :: 62 ; rRNAs :: 1, 1, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1 (5S, 16S) ; partial rRNAs :: 2 (23S) ; tRNAs :: 55 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 23 ; CDSs (without protein) :: 23 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 23 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 6 of 23 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 18 of 23 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 2 of 23 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 3 of 23 ; CRISPR Arrays :: 2 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
|
| 参照 |
1
|
| タイトル |
Kineosporia and Streptomyces sp. nov. two new marine actinobacteria isolated from Coral
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Buangrab,K. Sutthacheep,M. Yeemin,T. Harunari,E. Igarashi,Y. Kanchanasin,P. Tanasupawat,S. Phongsopitanun,W.
|
| PubMed |
|
| 参照 |
2
|
| タイトル |
Direct Submission
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (10-MAY-2021) Biochemistry and Microbiology, Faculty of Pharmaceutical Sciences, Chulalongkorn University, 254 Phyathai Rd., Bangkok 10330, Thailand
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Buangrab,K. Sutthacheep,M. Yeemin,T. Harunari,E. Igarashi,Y. Kanchanasin,P. Tanasupawat,S. Phongsopitanun,W.
|
| PubMed |
|
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
