| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004136
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（Paeniglutamicibacter quisquiliarum strain ABSL32-1, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Paeniglutamicibacter quisquiliarum
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| アクセッション番号またはID |
JAHRED000000000
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| コメント |
Paeniglutamicibacter quisquiliarum strain ABSL32-1, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
JAHRED000000000.1
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| 登録日または更新日 |
2021-06-30
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
35
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
ABSL32-1
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| 分離源 |
waste area
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
The Paeniglutamicibacter quisquiliarum whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JAHRED000000000. This version of the project (01) has the accession number JAHRED010000000, and consists of sequences JAHRED010000001-JAHRED010000035.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from Onruthai Pinyakong, Department of Micriobiology, Faculty of Science, Chulalongkorn University, 254 Phayathai Rd. Wangmai Patumwan Bangkok 10330.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 20-MAY-2021 ; Assembly Method :: Unicycler v. 0.4.9 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 105.0x ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 06/25/2021 15:42:57 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.2 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 4,033 ; CDSs (total) :: 3,968 ; Genes (coding) :: 3,933 ; CDSs (with protein) :: 3,933 ; Genes (RNA) :: 65 ; rRNAs :: 2, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 58 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 35 ; CDSs (without protein) :: 35 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 35 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 12 of 35 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 19 of 35 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 7 of 35 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 2 of 35 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Paeniglutamicibacter middenicola sp. nov., isolated from midden soil waste
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Sakdapetsiri,C. Ngaemthao,W. Suriyachadkun,C. Pinyakong,O.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (17-JUN-2021) Microbiology, Chulalongkorn University, 254 Phayathai Rd., Bangkok, Bangkok 10330, Thailand
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Sakdapetsiri,C. Ngaemthao,W. Suriyachadkun,C. Pinyakong,O.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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