| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004144
|
|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（Glycomyces amatae strain A-F 0318, whole genome shotgun sequencing project）
|
| 生物種名 |
Glycomyces amatae
|
| アクセッション番号またはID |
JAJLQZ000000000
|
| コメント |
Glycomyces amatae strain A-F 0318, whole genome shotgun sequencing project.
|
| ゲノム配列のバージョン |
JAJLQZ000000000.1
|
| 登録日または更新日 |
2021-11-28
|
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
69
|
| 形態 |
linear
|
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
|
| strain |
A-F 0318
|
| 分離源 |
|
| plasmid |
|
| 備考 |
|
| 菌株へのコメント |
The Glycomyces amatae whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JAJLQZ000000000. This version of the project (01) has the accession number JAJLQZ010000000, and consists of sequences JAJLQZ010000001-JAJLQZ010000069.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 05-AUG-2021 ; Assembly Method :: SPAdes v. 3.10.1 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 322.6x ; Sequencing Technology :: Illumina NovaSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 11/22/2021 16:09:16 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 5.3 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA; repeat_region ; Genes (total) :: 5,724 ; CDSs (total) :: 5,670 ; Genes (coding) :: 5,576 ; CDSs (with protein) :: 5,576 ; Genes (RNA) :: 54 ; rRNAs :: 1, 1 (16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1 (16S, 23S) ; tRNAs :: 49 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 94 ; CDSs (without protein) :: 94 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 94 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 10 of 94 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 88 of 94 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 4 of 94 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 7 of 94 ; CRISPR Arrays :: 6 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
|
| 参照 |
1
|
| タイトル |
Glycomyces sp. A-F 0318, a novel actinomycete isolated from Amata sperbius
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Suriyachadkun,C.
|
| PubMed |
|
| 参照 |
2
|
| タイトル |
Direct Submission
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (22-NOV-2021) Thailand Bioresource Research Center (TBRC), National Center for Genetic Engineering and Biotechnology (BIOTEC), Phahonyothin Road, Pathum Thani 12120, Thailand
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Suriyachadkun,C.
|
| PubMed |
|
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
