| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
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解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004163
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| データタイトル |
ゲノム（Starmerella potacharoeniae strain NBRC 106439, AB537437, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Starmerella potacharoeniae
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| アクセッション番号またはID |
JAKUBX000000000
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| コメント |
Starmerella potacharoeniae strain NBRC 106439, AB537437, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
JAKUBX000000000.1
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| 登録日または更新日 |
2023-07-31
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
209
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
NBRC 106439, AB537437
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| 分離源 |
NBRC Collection
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
The Starmerella potacharoeniae whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JAKUBX000000000. This version of the project (01) has the accession number JAKUBX010000000, and consists of sequences JAKUBX010000001-JAKUBX010000209.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPADES v. 3.7 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 188.507332257x ; Sequencing Technology :: Illumina HiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Genomic and ecological factors shaping specialism and generalism across an entire subphylum
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| 雑誌名/登録機関名 |
bioRxiv (2023)
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Opulente,D.A. LaBella,A.L. Harrison,M.-C. Wolters,J.F. Liu,C. Li,Y. Kominek,J. Steenwyk,J.L. Stoneman,H.R. VanDenAvond,J. Miller,C.R. Langdon,Q.K. Silva,M. Goncalves,C. Ubbelohde,E.J. Li,Y. Buh,K.V. Jarzyna,M. Haase,M.A.B. Rosa,C.A. Cadez,N. Libkind,D. DeVirgilio,J.H. Hulfachor,A.B. Kurtzman,C.P. Sampaio,J.P. Goncalves,P. Zhou,X. Shen,X.-X. Groenewald,M. Rokas,A. Hittinger,C.T.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (18-FEB-2022) Genetics, UW-Madison, 1552 University Avenue, Madison, WI 53726, USA
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Kominek,J. Opulente,D.A. Shen,X. Zhou,X. Hittinger,C.T. Rokas,A.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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