解析情報 ゲノム

データID
ANGE0000000004175
データタイトル
ゲノム(Ogataea corticis strain NBRC 1794, whole genome shotgun sequencing project)
生物種名
Ogataea corticis
アクセッション番号またはID
JANIVM000000000
コメント
Ogataea corticis strain NBRC 1794, whole genome shotgun sequencing project.
ゲノム配列のバージョン
JANIVM000000000.1
登録日または更新日
2023-07-31
配列取得用URL
配列ファイルダウンロード
配列長(bp)または配列数(rc)
173
形態
linear
BioProject
BioSample
配列の種類
genomic DNA
strain
NBRC 1794
分離源
NBRC Collection
plasmid
備考
菌株へのコメント
The Ogataea corticis whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JANIVM000000000. This version of the project (01) has the accession number JANIVM010000000, and consists of sequences JANIVM010000001-JANIVM010000173.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPADES v. 3.7 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 389.123872087x ; Sequencing Technology :: Illumina HiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##
参照
1
  タイトル
Genomic and ecological factors shaping specialism and generalism across an entire subphylum
  雑誌名/登録機関名
bioRxiv (2023)
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者
Opulente,D.A. LaBella,A.L. Harrison,M.-C. Wolters,J.F. Liu,C. Li,Y. Kominek,J. Steenwyk,J.L. Stoneman,H.R. VanDenAvond,J. Miller,C.R. Langdon,Q.K. Silva,M. Goncalves,C. Ubbelohde,E.J. Li,Y. Buh,K.V. Jarzyna,M. Haase,M.A.B. Rosa,C.A. Cadez,N. Libkind,D. DeVirgilio,J.H. Hulfachor,A.B. Kurtzman,C.P. Sampaio,J.P. Goncalves,P. Zhou,X. Shen,X.-X. Groenewald,M. Rokas,A. Hittinger,C.T.
  PubMed
参照
2
  タイトル
Direct Submission
  雑誌名/登録機関名
Submitted (28-JUL-2022) Genetics, UW-Madison, 1552 University Avenue, Madison, WI 53726, USA
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者
Kominek,J. Opulente,D.O. Shen,X. Zhou,X. Hittinger,C.T. Rokas,A.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ
1.微生物株情報 1件
2.微生物種情報 1件
5.文献情報 0件

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7.コレクション情報 1件
8.提供機関情報 1件
9.実験情報 0件

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10.プロジェクト情報 0件

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