| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004196 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（Brucella sp. NBRC 113783, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Brucella sp. NBRC 113783 |
| アクセッション番号またはID | JAWWND000000000 |
| コメント | Brucella sp. NBRC 113783, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | JAWWND000000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-11-18 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 266 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 113783 |
| 分離源 | |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | The Brucella sp. NBRC 113783 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession JAWWND000000000. This version of the project (01) has the accession number JAWWND010000000, and consists of sequences JAWWND010000001-JAWWND010000266.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPAdes v. 3.15.5 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 250.0x ; Sequencing Technology :: Illumina NovaSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI ; Annotation Date :: 11/13/2023 13:20:06 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 5,057 ; CDSs (total) :: 5,004 ; Genes (coding) :: 4,950 ; CDSs (with protein) :: 4,950 ; Genes (RNA) :: 53 ; rRNAs :: 1, 1, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1 (5S, 16S) ; partial rRNAs :: 2 (23S) ; tRNAs :: 45 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 54 ; CDSs (without protein) :: 54 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 54 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 18 of 54 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 35 of 54 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 12 of 54 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 10 of 54 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Clinical study on Brucella sp. NBRC 113783 |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Li,S. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (07-NOV-2023) Science & Research, Guangdong Provincial Hospital of Traditional Chinese Medicine, No. 55, Neihuan West Road, University Town, Panyu District, Guangzhou, Guangdong Province, Guangzhou 510006, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Li,S. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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