| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004205 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Aquipluma nitroreducens strain MeG22 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Aquipluma nitroreducens |
| アクセッション番号またはID | NZ_AP018694 |
| コメント | Aquipluma nitroreducens strain MeG22 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_AP018694.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-11-09 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 5712279 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | MeG22 |
| 分離源 | lake water |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP018694.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SMRT v. 2.3.0 ; Genome Coverage :: 193X ; Sequencing Technology :: PacBio RS II ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 11/09/2023 12:41:30 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,768 ; CDSs (total) :: 4,706 ; Genes (coding) :: 4,687 ; CDSs (with protein) :: 4,687 ; Genes (RNA) :: 62 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 53 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 19 ; CDSs (without protein) :: 19 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 19 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 7 of 19 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 8 of 19 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 6 of 19 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 1 of 19 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Aquipluma nitroreducens gen. nov. sp. nov., a novel facultatively anaerobic bacterium isolated from a freshwater lake |
| 雑誌名/登録機関名 | Int J Syst Evol Microbiol 70 (12), 6408-6413 (2020) |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Watanabe,M. Kojima,H. Fukui,M. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (25-MAY-2018) Contact:Miho Watanabe Akita Prefectural University, Faculty of Bioresource Sciences, Department of Biological Environment; 241-438 Kaidobata-Nishi, Nakano, Shimoshinjo, Akita 010-0195, Japan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Watanabe,M. Kojima,H. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
Not found
7.コレクション情報
8.提供機関情報
9.実験情報
Not found
10.プロジェクト情報
Not found
