| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004208 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Paraburkholderia sp. PGU16 plasmid PPGU16_p1, complete sequence） |
| 生物種名 | Paraburkholderia sp. PGU16 |
| アクセッション番号またはID | NZ_AP023176 |
| コメント | Paraburkholderia sp. PGU16 plasmid PPGU16_p1, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_AP023176.1 |
| 登録日または更新日 | 2020-07-23 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 2342401 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | PGU16 |
| 分離源 | Midgut crypts of stink bug Physopelta gutta |
| plasmid | PPGU16_p1 |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP023176.1.; Annotated at DFAST https://dfast.nig.ac.jp/~~; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: HGAP v. 3 ; Genome Coverage :: 141x ; Sequencing Technology :: PacBio RS II; ABI 3730xl ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 03/19/2023 21:46:41 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.4 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 8,544 ; CDSs (total) :: 8,459 ; Genes (coding) :: 8,334 ; CDSs (with protein) :: 8,334 ; Genes (RNA) :: 85 ; rRNAs :: 6, 6, 6 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 6, 6, 6 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 63 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 125 ; CDSs (without protein) :: 125 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 125 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 63 of 125 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 77 of 125 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 20 of 125 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 32 of 125 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Genomic Comparison of Insect Gut Symbionts from Divergent Burkholderia Subclades |
| 雑誌名/登録機関名 | Genes (Basel) 11 (7), 744 (2020) |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Takeshita,K. Kikuchi,Y. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (25-MAY-2020) Contact:Kazutaka Takeshita Akita Prefectural University, Faculty of Bioresource Sciences; 241-438 Kaidobata-Nishi, Shimoshinjo Nakano, Akita City, Akita 010-0195, Japan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Takeshita,K. Kikuchi,Y. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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