| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004236 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Acaryochloris marina MBIC10699 plasmid pREC1, complete sequence） |
| 生物種名 | Acaryochloris marina MBIC10699 |
| アクセッション番号またはID | NZ_AP026076 |
| コメント | Acaryochloris marina MBIC10699 plasmid pREC1, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_AP026076.1 |
| 登録日または更新日 | 2022-09-29 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 393608 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | MBIC10699 |
| 分離源 | |
| plasmid | pREC1 |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP026076.1.; Annotated at DFAST https://dfast.nig.ac.jp/~~; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Flye v. 2.7 ; Genome Coverage :: 110x ; Sequencing Technology :: Miseq; GridION ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 10/08/2023 15:02:00 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 6,960 ; CDSs (total) :: 6,877 ; Genes (coding) :: 6,672 ; CDSs (with protein) :: 6,672 ; Genes (RNA) :: 83 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 73 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 205 ; CDSs (without protein) :: 205 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 205 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 78 of 205 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 145 of 205 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 38 of 205 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 49 of 205 ; CRISPR Arrays :: 2 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Genome Sequencing of Acaryochloris species MBCIC10699 and assembly |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Yamamoto,H. Uesaka,K. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (16-JUN-2022) Contact:Haruki Yamamoto Nagoya University, Graduate school of Bioagricultural Sciences; Chikusa-ku, Fro-cho, Nagoya, Aichi 464-8601, Japan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Yamamoto,H. Uesaka,K. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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