| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004248
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Microbacterium terricola strain KV-448 chromosome, complete genome）
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| 生物種名 |
Microbacterium terricola
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| アクセッション番号またはID |
NZ_AP027141
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| コメント |
Microbacterium terricola strain KV-448 chromosome, complete genome.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_AP027141.1
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| 登録日または更新日 |
2023-05-11
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
3251508
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| 形態 |
circular
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
KV-448
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| 分離源 |
soil
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP027141.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Annotated by DFAST https://dfast.ddbj.nig.ac.jp/~~; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPAdes v. 3.6.0 ; Genome Coverage :: 20x ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 05/11/2023 16:33:15 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,096 ; CDSs (total) :: 3,044 ; Genes (coding) :: 3,029 ; CDSs (with protein) :: 3,029 ; Genes (RNA) :: 52 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 46 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 15 ; CDSs (without protein) :: 15 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 15 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 1 of 15 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 14 of 15 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 1 of 15 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 1 of 15 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length.
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Microbacterium terricola strain KV-448 chromosome, complete genome
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Oshima,T. Moriya,T. Bessho,Y.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (31-DEC-2022) Contact:Yoshitaka Bessho RIKEN, SPring-8 Center; Kouto 1-1-1, Sayo, Hyogo 679-5148, Japan URL :http://www.spring8.or.jp
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Oshima,T. Moriya,T. Bessho,Y.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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