| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004248 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Microbacterium terricola strain KV-448 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Microbacterium terricola |
| アクセッション番号またはID | NZ_AP027141 |
| コメント | Microbacterium terricola strain KV-448 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_AP027141.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-05-11 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3251508 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | KV-448 |
| 分離源 | soil |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP027141.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Annotated by DFAST https://dfast.ddbj.nig.ac.jp/~~; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPAdes v. 3.6.0 ; Genome Coverage :: 20x ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 05/11/2023 16:33:15 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,096 ; CDSs (total) :: 3,044 ; Genes (coding) :: 3,029 ; CDSs (with protein) :: 3,029 ; Genes (RNA) :: 52 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 46 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 15 ; CDSs (without protein) :: 15 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 15 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 1 of 15 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 14 of 15 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 1 of 15 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 1 of 15 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Microbacterium terricola strain KV-448 chromosome, complete genome |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Oshima,T. Moriya,T. Bessho,Y. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (31-DEC-2022) Contact:Yoshitaka Bessho RIKEN, SPring-8 Center; Kouto 1-1-1, Sayo, Hyogo 679-5148, Japan URL :http://www.spring8.or.jp |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Oshima,T. Moriya,T. Bessho,Y. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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