| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004265 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Brooklawnia propionicigenes strain SH051 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Brooklawnia propionicigenes |
| アクセッション番号またはID | NZ_AP028056 |
| コメント | Brooklawnia propionicigenes strain SH051 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_AP028056.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-06-24 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3211969 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | SH051 |
| 分離源 | a methanogenic reactor |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to AP028056.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Annotated by DFAST https://dfast.ddbj.nig.ac.jp/~~; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Flye v. 2.9.1-b1780 ; Genome Coverage :: 58x ; Sequencing Technology :: PacBio Sequel IIe ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Name :: GCF_030297015.1-RS_2024_04_28 ; Annotation Date :: 04/28/2024 10:04:12 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.7 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 2,945 ; CDSs (total) :: 2,891 ; Genes (coding) :: 2,846 ; CDSs (with protein) :: 2,846 ; Genes (RNA) :: 54 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 45 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 45 ; CDSs (without protein) :: 45 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 45 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 12 of 45 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 35 of 45 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 2 of 45 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 4 of 45 ; CRISPR Arrays :: 2 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Brooklawnia propionicigenes sp. nov., a facultatively anaerobic, propionate-producing bacterium isolated from a methanogenic reactor treating waste from cattle farms |
| 雑誌名/登録機関名 | Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 74, 006320 (2024) |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Akita,Y. Ueki,A. Tonouchi,A. Sugawara,Y. Honma,S. Kaku,N. Ueki,K. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (25-APR-2023) Contact:Akio Tonouchi Hirosaki University, Faculty of Agriculture and Life Science; 3 Bunkyo-cho, Hirosaki, Aomori 036-8561, Japan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Ueki,A. Tonouchi,A. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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