| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004303 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Lolliginicoccus levis strain Y7R2, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Lolliginicoccus levis |
| アクセッション番号またはID | NZ_BQYM00000000 |
| コメント | Lolliginicoccus levis strain Y7R2, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_BQYM00000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-04-13 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3610368 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | Y7R2 |
| 分離源 | Seawater |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to BQYM00000000.1.; The Lolliginicoccus levis whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_BQYM00000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_BQYM01000000, and consists of sequences BQYM01000001-BQYM01000035.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Spades v. 3.1.2; Pilon v. 1.23 ; Genome Coverage :: 152x ; Sequencing Technology :: Illumina iSeq 100 System ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 09/10/2023 23:12:52 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,289 ; CDSs (total) :: 3,237 ; Genes (coding) :: 3,214 ; CDSs (with protein) :: 3,214 ; Genes (RNA) :: 52 ; rRNAs :: 1, 1, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1 (5S, 16S) ; partial rRNAs :: 2 (23S) ; tRNAs :: 45 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 23 ; CDSs (without protein) :: 23 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 23 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 3 of 23 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 19 of 23 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 3 of 23 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 1 of 23 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Lolliginicoccus levis gen. nov., sp. nov., a novel bacterium isolated from the brain of the Chiroteuthis picteti squid, and reclassification of two Hoyosella species as Lolliginicoccus suaedae comb. nov. and Lolliginicoccus lacisalsi comb. nov |
| 雑誌名/登録機関名 | Int J Syst Evol Microbiol 73 (4) (2023) |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Miyanishi,M. Hamada,M. Taniguchi,T. Enomoto,N. Oota,T. Teramoto,M. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (22-APR-2022) Contact:Maki Teramoto Kochi University, Marine Resource Science; Otsu 200, Monobe, Nankoku, Kochi 783-8502, Japan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Teramoto,M. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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