| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004307 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Neptunitalea chrysea strain NBRC 110019, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Neptunitalea chrysea |
| アクセッション番号またはID | NZ_BRVP00000000 |
| コメント | Neptunitalea chrysea strain NBRC 110019, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_BRVP00000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-05-11 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3780364 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 110019 |
| 分離源 | seawater |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to BRVP00000000.1.; The Neptunitalea chrysea whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_BRVP00000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_BRVP01000000, and consists of sequences BRVP01000001-BRVP01000088.; Genome-Assembly-Data~~Annotated by DFAST https://dfast.ddbj.nig.ac.jp/~~; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Unicycler v. 0.4.8 ; Genome Coverage :: 77x ; Sequencing Technology :: DNBSEG-G400FAST ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 09/10/2023 23:47:46 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,366 ; CDSs (total) :: 3,309 ; Genes (coding) :: 3,267 ; CDSs (with protein) :: 3,267 ; Genes (RNA) :: 57 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 50 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 42 ; CDSs (without protein) :: 42 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 42 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 10 of 42 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 33 of 42 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 6 of 42 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 6 of 42 ; CRISPR Arrays :: 4 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Taxonomy of Novel Oxalotrophic and Methylotrophic Bacteria |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Sahin,N. Tani,A. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Taxonomy of Novel Oxalotrophic and Methylotrophic Bacteria |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Sahin,N. Tani,A. |
| PubMed | |
| 参照 | 3 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (26-JUL-2022) Contact:Nurettin Sahin Mugla Sitki Kocman University, Egitim Fakultesi; Kotekli Kampusu, Mugla 48100, Turkey |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Sahin,N. Tani,A. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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