| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004307
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Neptunitalea chrysea strain NBRC 110019, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Neptunitalea chrysea
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| アクセッション番号またはID |
NZ_BRVP00000000
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| コメント |
Neptunitalea chrysea strain NBRC 110019, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_BRVP00000000.1
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| 登録日または更新日 |
2023-05-11
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
3780364
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
NBRC 110019
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| 分離源 |
seawater
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to BRVP00000000.1.; The Neptunitalea chrysea whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_BRVP00000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_BRVP01000000, and consists of sequences BRVP01000001-BRVP01000088.; Genome-Assembly-Data~~Annotated by DFAST https://dfast.ddbj.nig.ac.jp/~~; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: Unicycler v. 0.4.8 ; Genome Coverage :: 77x ; Sequencing Technology :: DNBSEG-G400FAST ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 09/10/2023 23:47:46 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,366 ; CDSs (total) :: 3,309 ; Genes (coding) :: 3,267 ; CDSs (with protein) :: 3,267 ; Genes (RNA) :: 57 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 50 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 42 ; CDSs (without protein) :: 42 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 42 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 10 of 42 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 33 of 42 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 6 of 42 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 6 of 42 ; CRISPR Arrays :: 4 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Taxonomy of Novel Oxalotrophic and Methylotrophic Bacteria
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Sahin,N. Tani,A.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Taxonomy of Novel Oxalotrophic and Methylotrophic Bacteria
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Sahin,N. Tani,A.
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| PubMed |
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| 参照 |
3
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (26-JUL-2022) Contact:Nurettin Sahin Mugla Sitki Kocman University, Egitim Fakultesi; Kotekli Kampusu, Mugla 48100, Turkey
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Sahin,N. Tani,A.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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