| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004308 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Arthrobacter mangrovi strain NBRC 112813, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Arthrobacter mangrovi |
| アクセッション番号またはID | NZ_BRVS00000000 |
| コメント | Arthrobacter mangrovi strain NBRC 112813, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_BRVS00000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2022-11-08 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 4426898 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 112813 |
| 分離源 | soil |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to BRVS00000000.1.; The Arthrobacter mangrovi whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_BRVS00000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_BRVS01000000, and consists of sequences BRVS01000001-BRVS01000052.; Annotated by DFAST https://dfast.ddbj.nig.ac.jp/~~; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: CLC genomic workbench v. 12.0 ; Genome Coverage :: 78X ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 09/10/2023 23:47:28 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,068 ; CDSs (total) :: 4,008 ; Genes (coding) :: 3,979 ; CDSs (with protein) :: 3,979 ; Genes (RNA) :: 60 ; rRNAs :: 2, 2, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; partial rRNAs :: 1 (16S) ; tRNAs :: 52 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 29 ; CDSs (without protein) :: 29 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 29 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 4 of 29 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 24 of 29 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 4 of 29 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 2 of 29 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Arthrobacter mangrovi sp. nov., an actinobacterium isolated from the rhizosphere of a mangrove |
| 雑誌名/登録機関名 | Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 73 (2023) In press |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Hamada,M. Saitou,S. Enomoto,N. Nanri,K. Hidaka,K. Miura,T. Tamura,T. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (22-JUL-2022) Contact:Moriyuki Hamada National Institute of Technology and Evaluation; Kazusa Kamatari, 2-5-8, Kisarazu, Chiba 292-0818, Japan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Hamada,M. Tamura,T. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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