| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004478 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Bacillus mycoides NBRC 101238 = DSM 11821, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Bacillus mycoides NBRC 101238 = DSM 11821 |
| アクセッション番号またはID | NZ_CAKJVL000000000 |
| コメント | Bacillus mycoides NBRC 101238 = DSM 11821, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_CAKJVL000000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-05-26 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 5589280 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | |
| 分離源 | Culture Collection |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CAKJVL000000000.1.; The Bacillus mycoides NBRC 101238 = DSM 11821 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_CAKJVL000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_CAKJVL010000000, and consists of sequences CAKJVL010000001-CAKJVL010000083.; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 05/25/2023 08:23:04 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 5,735 ; CDSs (total) :: 5,624 ; Genes (coding) :: 5,372 ; CDSs (with protein) :: 5,372 ; Genes (RNA) :: 111 ; rRNAs :: 8, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 6, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; partial rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 92 ; ncRNAs :: 5 ; Pseudo Genes (total) :: 252 ; CDSs (without protein) :: 252 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 252 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 105 of 252 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 170 of 252 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 72 of 252 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 77 of 252 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (22-OCT-2021) AARHUS UNIVERSITY, DEPARTMENT OF FOOD SCIENCE, AGRO FOOD PARK 48, 8200 AARHUS N, Denmark |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Metto,D. Hammersh?j,M. Xiao,Y. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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