| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
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解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004478
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| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Bacillus mycoides NBRC 101238 = DSM 11821, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Bacillus mycoides NBRC 101238 = DSM 11821
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| アクセッション番号またはID |
NZ_CAKJVL000000000
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| コメント |
Bacillus mycoides NBRC 101238 = DSM 11821, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_CAKJVL000000000.1
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| 登録日または更新日 |
2023-05-26
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
5589280
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
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| 分離源 |
Culture Collection
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CAKJVL000000000.1.; The Bacillus mycoides NBRC 101238 = DSM 11821 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_CAKJVL000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_CAKJVL010000000, and consists of sequences CAKJVL010000001-CAKJVL010000083.; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 05/25/2023 08:23:04 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 5,735 ; CDSs (total) :: 5,624 ; Genes (coding) :: 5,372 ; CDSs (with protein) :: 5,372 ; Genes (RNA) :: 111 ; rRNAs :: 8, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 6, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; partial rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 92 ; ncRNAs :: 5 ; Pseudo Genes (total) :: 252 ; CDSs (without protein) :: 252 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 252 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 105 of 252 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 170 of 252 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 72 of 252 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 77 of 252 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (22-OCT-2021) AARHUS UNIVERSITY, DEPARTMENT OF FOOD SCIENCE, AGRO FOOD PARK 48, 8200 AARHUS N, Denmark
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Metto,D. Hammersh?j,M. Xiao,Y.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
