| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
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解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004480
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| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Nocardia veterana NBRC 100344 isolate ena-yuan-GCF_000308855.1, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Nocardia veterana NBRC 100344
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| アクセッション番号またはID |
NZ_CAWLLA000000000
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| コメント |
Nocardia veterana NBRC 100344 isolate ena-yuan-GCF_000308855.1, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_CAWLLA000000000.1
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| 登録日または更新日 |
2024-04-06
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
6785212
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
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| 分離源 |
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CAWLLA000000000.1.; The Nocardia veterana NBRC 100344 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_CAWLLA000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_CAWLLA010000000, and consists of sequences CAWLLA010000001-CAWLLA010000210.; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Name :: GCF_963861485.1-RS_2024_04_06 ; Annotation Date :: 04/06/2024 12:03:10 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.7 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 6,177 ; CDSs (total) :: 6,120 ; Genes (coding) :: 5,993 ; CDSs (with protein) :: 5,993 ; Genes (RNA) :: 57 ; rRNAs :: 1, 1, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1 (5S, 16S) ; partial rRNAs :: 2 (23S) ; tRNAs :: 50 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 127 ; CDSs (without protein) :: 127 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 127 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 18 of 127 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 115 of 127 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 3 of 127 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 9 of 127 ; CRISPR Arrays :: 2 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (15-DEC-2023) NAU, Nanjing 210095, China, China
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Yuan,S.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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