| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004481
|
|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Vibrio campbellii CAIM 519 = NBRC 15631 = ATCC 25920 isolate ena-yuan-GCF_000400345.1, whole genome shotgun sequencing project）
|
| 生物種名 |
Vibrio campbellii CAIM 519 = NBRC 15631 = ATCC 25920
|
| アクセッション番号またはID |
NZ_CAWLXW000000000
|
| コメント |
Vibrio campbellii CAIM 519 = NBRC 15631 = ATCC 25920 isolate ena-yuan-GCF_000400345.1, whole genome shotgun sequencing project.
|
| ゲノム配列のバージョン |
NZ_CAWLXW000000000.1
|
| 登録日または更新日 |
2024-04-06
|
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
5116899
|
| 形態 |
linear
|
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
|
| strain |
|
| 分離源 |
|
| plasmid |
|
| 備考 |
|
| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CAWLXW000000000.1.; The Vibrio campbellii CAIM 519 = NBRC 15631 = ATCC 25920 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_CAWLXW000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_CAWLXW010000000, and consists of sequences CAWLXW010000001-CAWLXW010000387.; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Name :: GCF_963864815.1-RS_2024_04_06 ; Annotation Date :: 04/06/2024 11:40:14 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.7 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,756 ; CDSs (total) :: 4,714 ; Genes (coding) :: 4,527 ; CDSs (with protein) :: 4,527 ; Genes (RNA) :: 42 ; rRNAs :: 1, 7, 7 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1 (5S) ; partial rRNAs :: 7, 7 (16S, 23S) ; tRNAs :: 22 ; ncRNAs :: 5 ; Pseudo Genes (total) :: 187 ; CDSs (without protein) :: 187 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 187 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 65 of 187 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 128 of 187 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 50 of 187 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 45 of 187 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
|
| 参照 |
1
|
| タイトル |
Direct Submission
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (15-DEC-2023) NAU, Nanjing 210095, China, China
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Yuan,S.
|
| PubMed |
|
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
