解析情報 ゲノム

データID ANGE0000000004483
データタイトル ゲノム(RefSeq:Nocardia jejuensis NBRC 103114 isolate ena-yuan-GCF_001613145.1, whole genome shotgun sequencing project)
生物種名 Nocardia jejuensis NBRC 103114
アクセッション番号またはID NZ_CAWMPO000000000
コメント Nocardia jejuensis NBRC 103114 isolate ena-yuan-GCF_001613145.1, whole genome shotgun sequencing project.
ゲノム配列のバージョン NZ_CAWMPO000000000.1
登録日または更新日 2024-04-06
配列取得用URL
配列ファイルダウンロード
配列長(bp)または配列数(rc) 8654199
形態 linear
BioProject
BioSample
配列の種類 genomic DNA
strain
分離源
plasmid
備考
菌株へのコメント REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CAWMPO000000000.1.; The Nocardia jejuensis NBRC 103114 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_CAWMPO000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_CAWMPO010000000, and consists of sequences CAWMPO010000001-CAWMPO010000089.; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Name :: GCF_963869495.1-RS_2024_04_06 ; Annotation Date :: 04/06/2024 12:57:11 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.7 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 7,670 ; CDSs (total) :: 7,591 ; Genes (coding) :: 7,498 ; CDSs (with protein) :: 7,498 ; Genes (RNA) :: 79 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 73 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 93 ; CDSs (without protein) :: 93 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 93 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 8 of 93 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 89 of 93 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 2 of 93 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 5 of 93 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
参照 1
  タイトル Direct Submission
  雑誌名/登録機関名 Submitted (15-DEC-2023) NAU, Nanjing 210095, China, China
  出版年月
  巻・号・ページ
  著者 Yuan,S.
  PubMed
関連情報

このデータにリンクしている情報

提供機関 1 Taxonomy プロジェクト 0 コレクション 1 微生物種 1 実験 0 微生物株 1 属性 文献 0 解析データ

1.微生物株情報  1件

2.微生物種情報  1件

5.文献情報  0件

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7.コレクション情報  1件

8.提供機関情報  1件

9.実験情報  0件

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10.プロジェクト情報  0件

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