| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004490
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Cellulosimicrobium protaetiae strain BI34 plasmid pCPRO01, complete sequence）
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| 生物種名 |
Cellulosimicrobium protaetiae
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| アクセッション番号またはID |
NZ_CP052758
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| コメント |
Cellulosimicrobium protaetiae strain BI34 plasmid pCPRO01, complete sequence.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_CP052758.1
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| 登録日または更新日 |
2020-05-20
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
152586
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| 形態 |
circular
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
BI34
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| 分離源 |
intestine from larvae
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| plasmid |
pCPRO01
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP052758.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: JUL-2019 ; Assembly Method :: HGAP v. 3.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 178.0x ; Sequencing Technology :: PacBio RSII; Illumina HiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 03/08/2024 01:59:43 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,155 ; CDSs (total) :: 4,092 ; Genes (coding) :: 4,075 ; CDSs (with protein) :: 4,075 ; Genes (RNA) :: 63 ; rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 51 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 17 ; CDSs (without protein) :: 17 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 17 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 2 of 17 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 15 of 17 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 1 of 17 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 1 of 17 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length.
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Cellulosimicrobium protaetiae sp. nov., isolated from the gut of the larva of Protaetia brevitarsis seulensis
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| 雑誌名/登録機関名 |
Int J Syst Evol Microbiol 72 (3) (2022)
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Le Han,H. Nguyen,T.T.H. Li,Z. Shin,N.R. Kim,S.G.
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| PubMed | |
| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (17-APR-2020) Korean Collection for Type Cultures (KCTC), Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB), 181 Ipsin-gil, Jeongeup-si, Jeollabuk-do 56212, Korea, Republic of
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Ho,H. Kim,S.-G.
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| PubMed |
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| 参照 |
3
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (06-NOV-2019) Korean Collection for Type Cultures (KCTC), Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB), 181 Ipsin-gil, Jeongeup-si, Jeollabuk-do 56212, Republic of Korea
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Le Ho,H. Kim,S.-G.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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