| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004490 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Cellulosimicrobium protaetiae strain BI34 plasmid pCPRO01, complete sequence） |
| 生物種名 | Cellulosimicrobium protaetiae |
| アクセッション番号またはID | NZ_CP052758 |
| コメント | Cellulosimicrobium protaetiae strain BI34 plasmid pCPRO01, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_CP052758.1 |
| 登録日または更新日 | 2020-05-20 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 152586 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | BI34 |
| 分離源 | intestine from larvae |
| plasmid | pCPRO01 |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP052758.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: JUL-2019 ; Assembly Method :: HGAP v. 3.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 178.0x ; Sequencing Technology :: PacBio RSII; Illumina HiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 03/08/2024 01:59:43 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,155 ; CDSs (total) :: 4,092 ; Genes (coding) :: 4,075 ; CDSs (with protein) :: 4,075 ; Genes (RNA) :: 63 ; rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 51 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 17 ; CDSs (without protein) :: 17 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 17 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 2 of 17 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 15 of 17 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 1 of 17 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 1 of 17 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Cellulosimicrobium protaetiae sp. nov., isolated from the gut of the larva of Protaetia brevitarsis seulensis |
| 雑誌名/登録機関名 | Int J Syst Evol Microbiol 72 (3) (2022) |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Le Han,H. Nguyen,T.T.H. Li,Z. Shin,N.R. Kim,S.G. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (17-APR-2020) Korean Collection for Type Cultures (KCTC), Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB), 181 Ipsin-gil, Jeongeup-si, Jeollabuk-do 56212, Korea, Republic of |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Ho,H. Kim,S.-G. |
| PubMed | |
| 参照 | 3 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (06-NOV-2019) Korean Collection for Type Cultures (KCTC), Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB), 181 Ipsin-gil, Jeongeup-si, Jeollabuk-do 56212, Republic of Korea |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Le Ho,H. Kim,S.-G. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
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7.コレクション情報
8.提供機関情報
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10.プロジェクト情報
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