| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004506
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| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Leucobacter allii strain H21R-36 chromosome, complete genome）
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| 生物種名 |
Leucobacter allii
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| アクセッション番号またはID |
NZ_CP095044
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| コメント |
Leucobacter allii strain H21R-36 chromosome, complete genome.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_CP095044.1
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| 登録日または更新日 |
2022-04-14
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
3655912
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| 形態 |
circular
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
H21R-36
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| 分離源 |
Rhizosphere of garlic
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP095044.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from Korean Agricultural Culture Collection (KACC).; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: MAR-2020 ; Assembly Method :: RS HGAP v. 3.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 175.0x ; Sequencing Technology :: PacBio RSII ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 05/22/2023 18:16:34 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,367 ; CDSs (total) :: 3,306 ; Genes (coding) :: 3,250 ; CDSs (with protein) :: 3,250 ; Genes (RNA) :: 61 ; rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 3, 3, 3 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 49 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 56 ; CDSs (without protein) :: 56 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 56 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 24 of 56 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 29 of 56 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 5 of 56 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 2 of 56 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length.
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Leucobacter sp. isolated from rhizosphere of garlic
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Won,M. Lee,C.-M. Woen,H.-Y. Kwon,S.-W.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (04-APR-2022) Agricultural Microbiology Division, National Institute of Agricultural Sciences, 166, Nongsaengmyeong-ro, Iseo-myeon, Wanju-gun, Jeollabuk-do 55365, South Korea
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Won,M. Lee,C.-M. Woen,H.-Y. Kwon,S.-W.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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