| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004513 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Brevibacillus ruminantium strain BB3-R1 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Brevibacillus ruminantium |
| アクセッション番号またはID | NZ_CP098755 |
| コメント | Brevibacillus ruminantium strain BB3-R1 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_CP098755.1 |
| 登録日または更新日 | 2022-06-18 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 5627247 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | BB3-R1 |
| 分離源 | Cow fecal |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP098755.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from KACC.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: MAY-2022 ; Assembly Method :: Microbial Assembly Application of SMRTLink v. 10.1 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 811.0x ; Sequencing Technology :: PacBio Sequel; Illumina HiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 12/17/2023 10:17:18 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 5,534 ; CDSs (total) :: 5,384 ; Genes (coding) :: 5,311 ; CDSs (with protein) :: 5,311 ; Genes (RNA) :: 150 ; rRNAs :: 9, 10, 10 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 9, 10, 10 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 116 ; ncRNAs :: 5 ; Pseudo Genes (total) :: 73 ; CDSs (without protein) :: 73 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 73 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 25 of 73 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 54 of 73 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 12 of 73 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 18 of 73 ; CRISPR Arrays :: 2 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Genome sequencing of Brevibacillus sp. BB3-R1 |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Heo,J. Lee,D. Won,M. Han,B.-H. Hong,S.-B. Kwon,S.-W. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (09-JUN-2022) Agricultural Mircrobiology Division, National Institute of Agricultural Sciences, 166 Nongsaengmyeong-ro, Iseo-myeon, Wanju-gun, Jeollabuk-do 55365, South Korea |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Heo,J. Lee,D. Won,M. Han,B.-H. Hong,S.-B. Kwon,S.-W. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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