| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004516 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Catalinimonas niigatensis strain NBRC 109829 chromosome, complete genome） |
| 生物種名 | Catalinimonas niigatensis |
| アクセッション番号またはID | NZ_CP119422 |
| コメント | Catalinimonas niigatensis strain NBRC 109829 chromosome, complete genome. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_CP119422.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-07-22 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 7134482 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 109829 |
| 分離源 | lake sediment |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP119422.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from Xiamen University.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: FALCON v. 0.3 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 304.0x ; Sequencing Technology :: PacBio ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 12/10/2023 13:05:57 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 5,869 ; CDSs (total) :: 5,821 ; Genes (coding) :: 5,801 ; CDSs (with protein) :: 5,801 ; Genes (RNA) :: 48 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 39 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 20 ; CDSs (without protein) :: 20 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 20 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 4 of 20 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 12 of 20 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 7 of 20 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 2 of 20 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Comparative genome analysis |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,B. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (17-NOV-2023) State Key Laboratory for Marine Environmental Science, Institute of Marine Microbes and Ecospheres, Xiamen University, A3-302, Zhoulongquan Building, Xiamen University (Xiang'an), Xiang'an, Xiamen, Fujian,(361102) China, Xiamen, Fujian 361102, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,B. |
| PubMed | |
| 参照 | 3 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (02-MAR-2023) State Key Laboratory for Marine Environmental Science, Institute of Marine Microbes and Ecospheres, Xiamen University, A3-302, Zhoulongquan Building, Xiamen University (Xiang'an), Xiang'an, Xiamen, Fujian,(361102) China, Xiamen, Fujian 361102, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,B. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
2.微生物種情報
5.文献情報
Not found
7.コレクション情報
8.提供機関情報
9.実験情報
Not found
10.プロジェクト情報
Not found
