| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004528 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Vibrio natriegens NBRC 15636 = ATCC 14048 = DSM 759 strain ATCC 14048 chromosome 1, complete sequence） |
| 生物種名 | Vibrio natriegens NBRC 15636 = ATCC 14048 = DSM 759 |
| アクセッション番号またはID | NZ_CP141822 |
| コメント | Vibrio natriegens NBRC 15636 = ATCC 14048 = DSM 759 strain ATCC 14048 chromosome 1, complete sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_CP141822.1 |
| 登録日または更新日 | 2024-01-17 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 3178004 |
| 形態 | circular |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | ATCC 14048 |
| 分離源 | salt marsh mud |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP141822.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from Binomica labs.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 19-DEC-2023 ; Assembly Method :: Flye v. 2.9.3-b1797 ; Assembly Name :: BINO_vnat_nophage ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: No ; Genome Coverage :: 60.0x ; Sequencing Technology :: Oxford Nanopore; Illumina NextSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 01/15/2024 13:52:24 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,596 ; CDSs (total) :: 4,426 ; Genes (coding) :: 4,405 ; CDSs (with protein) :: 4,405 ; Genes (RNA) :: 170 ; rRNAs :: 13, 12, 12 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 13, 12, 12 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 129 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 21 ; CDSs (without protein) :: 21 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 21 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 13 of 21 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 12 of 21 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 5 of 21 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 6 of 21 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length. |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Independent sequencing and analysis of Vibrio natriegens lab strain |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Cocioba,S. Lim,S.W. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (29-DEC-2023) Research, Binomica Labs, 4301 22nd St 3FL Studio 342, Long Island City, NY 11101, USA |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Cocioba,S. Lim,S.W. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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