| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004530
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Arachnia propionica strain NBRC 14587 chromosome, complete genome）
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| 生物種名 |
Arachnia propionica
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| アクセッション番号またはID |
NZ_CP146373
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| コメント |
Arachnia propionica strain NBRC 14587 chromosome, complete genome.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_CP146373.1
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| 登録日または更新日 |
2024-04-05
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
3307556
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| 形態 |
circular
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
NBRC 14587
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| 分離源 |
dental plaque
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to CP146373.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from extrinsic black tooth stain.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: unicycler v. 0.4.8 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 100.0x ; Sequencing Technology :: PacBio ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Name :: GCF_037055325.1-RS_2024_04_05 ; Annotation Date :: 04/05/2024 17:07:56 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.7 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 3,070 ; CDSs (total) :: 3,013 ; Genes (coding) :: 2,986 ; CDSs (with protein) :: 2,986 ; Genes (RNA) :: 57 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 48 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 27 ; CDSs (without protein) :: 27 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 27 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 7 of 27 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 23 of 27 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 5 of 27 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 6 of 27 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##; COMPLETENESS: full length.
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Pseudopropionibacterium propionica NBRC 14587, complete genome
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Xue,D.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (28-FEB-2024) Stomatology, Kunming Medical University, No. 1088 Middle Haiyuan Road, Kunming, Yunnan 650000, China
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Xue,D.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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