| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
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解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004531
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| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Lactobacillus acidophilus DSM 20079 = JCM 1132 = NBRC 13951 = CIP 76.13, whole genome shotgun sequence）
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| 生物種名 |
Lactobacillus acidophilus DSM 20079 = JCM 1132 = NBRC 13951 = CIP 76.13
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| アクセッション番号またはID |
NZ_HG313739
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| コメント |
Lactobacillus acidophilus DSM 20079 = JCM 1132 = NBRC 13951 = CIP 76.13, whole genome shotgun sequence.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_HG313739.1
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| 登録日または更新日 |
2013-09-27
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
26540
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
CIP 76.13
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| 分離源 |
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| plasmid |
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| 備考 |
SCF4-CIP76.13
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to HG313739.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 01/31/2024 02:19:47 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 1,923 ; CDSs (total) :: 1,858 ; Genes (coding) :: 1,766 ; CDSs (with protein) :: 1,766 ; Genes (RNA) :: 65 ; rRNAs :: 1, 1, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1 (5S) ; partial rRNAs :: 1, 2 (16S, 23S) ; tRNAs :: 58 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 92 ; CDSs (without protein) :: 92 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 92 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 64 of 92 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 24 of 92 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 19 of 92 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 13 of 92 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Draft Genome Sequence of five strains of Lactobacillus acidophilus: strain CIP 76.13T, isolated from human, strains CIRM 442 and CIRM 445 isolated from dairy products, and strains DSM 20242 and DSM 9126 of unknown origin
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Falentin,H. Cousin,S. Clermont,D. Creno,S. Ma,L. Loux,V. Bizet,C. Bouchier,C.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (12-JUN-2013) I.N.R.A, Unite MIG, Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas Cedex, FRANCE
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Loux,V.
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| PubMed |
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| 参照 |
3
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (07-MAY-2013) I.N.R.A, Unite MIG, Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas Cedex, FRANCE
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Loux,V.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
