| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004532 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Lactobacillus acidophilus DSM 20079 = JCM 1132 = NBRC 13951 = CIP 76.13, whole genome shotgun sequence） |
| 生物種名 | Lactobacillus acidophilus DSM 20079 = JCM 1132 = NBRC 13951 = CIP 76.13 |
| アクセッション番号またはID | NZ_HG313740 |
| コメント | Lactobacillus acidophilus DSM 20079 = JCM 1132 = NBRC 13951 = CIP 76.13, whole genome shotgun sequence. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_HG313740.1 |
| 登録日または更新日 | 2013-09-27 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 24091 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | CIP 76.13 |
| 分離源 | |
| plasmid | |
| 備考 | SCF5-CIP76.13 |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to HG313740.1.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 01/31/2024 02:19:47 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 1,923 ; CDSs (total) :: 1,858 ; Genes (coding) :: 1,766 ; CDSs (with protein) :: 1,766 ; Genes (RNA) :: 65 ; rRNAs :: 1, 1, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1 (5S) ; partial rRNAs :: 1, 2 (16S, 23S) ; tRNAs :: 58 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 92 ; CDSs (without protein) :: 92 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 92 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 64 of 92 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 24 of 92 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 19 of 92 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 13 of 92 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Draft Genome Sequence of five strains of Lactobacillus acidophilus: strain CIP 76.13T, isolated from human, strains CIRM 442 and CIRM 445 isolated from dairy products, and strains DSM 20242 and DSM 9126 of unknown origin |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Falentin,H. Cousin,S. Clermont,D. Creno,S. Ma,L. Loux,V. Bizet,C. Bouchier,C. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (12-JUN-2013) I.N.R.A, Unite MIG, Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas Cedex, FRANCE |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Loux,V. |
| PubMed | |
| 参照 | 3 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (07-MAY-2013) I.N.R.A, Unite MIG, Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas Cedex, FRANCE |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Loux,V. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
1.微生物株情報
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