| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004556
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| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Brachybacterium sillae strain EF45031, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Brachybacterium sillae
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| アクセッション番号またはID |
NZ_JAFEUW000000000
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| コメント |
Brachybacterium sillae strain EF45031, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_JAFEUW000000000.1
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| 登録日または更新日 |
2022-09-08
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
2668991
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
EF45031
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| 分離源 |
hot spring
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to JAFEUW000000000.1.; The Brachybacterium sillae whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_JAFEUW000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_JAFEUW010000000, and consists of sequences JAFEUW010000001-JAFEUW010000002.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from Silla University.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 16-NOV-2020 ; Assembly Method :: HGAP v. 3 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 125.0x ; Sequencing Technology :: PacBio RSII ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 06/18/2023 13:03:39 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 2,464 ; CDSs (total) :: 2,405 ; Genes (coding) :: 2,287 ; CDSs (with protein) :: 2,287 ; Genes (RNA) :: 59 ; rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 2, 2 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 50 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 118 ; CDSs (without protein) :: 118 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 118 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 47 of 118 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 83 of 118 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 13 of 118 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 24 of 118 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Brachybacterium sp. nov isolated from geothermal hot spring in Chungju, Republic of Korea
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Lee,S.-J.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (10-FEB-2021) Food Biotechnology, Silla University, 140 Baegyang-daero 700 Beon-gil Sasang-gu, Busan 46958, South Korea
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Lee,S.-J.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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