| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004563 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Paeniglutamicibacter quisquiliarum strain ABSL32-1, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Paeniglutamicibacter quisquiliarum |
| アクセッション番号またはID | NZ_JAHRED000000000 |
| コメント | Paeniglutamicibacter quisquiliarum strain ABSL32-1, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_JAHRED000000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2021-07-02 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 4439639 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | ABSL32-1 |
| 分離源 | waste area |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to JAHRED000000000.1.; The Paeniglutamicibacter quisquiliarum whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_JAHRED000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_JAHRED010000000, and consists of sequences JAHRED010000001-JAHRED010000035.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from Onruthai Pinyakong, Department of Micriobiology, Faculty of Science, Chulalongkorn University, 254 Phayathai Rd. Wangmai Patumwan Bangkok 10330.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 20-MAY-2021 ; Assembly Method :: Unicycler v. 0.4.9 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 105.0x ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 03/08/2024 02:52:27 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,039 ; CDSs (total) :: 3,974 ; Genes (coding) :: 3,945 ; CDSs (with protein) :: 3,945 ; Genes (RNA) :: 65 ; rRNAs :: 2, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 58 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 29 ; CDSs (without protein) :: 29 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 29 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 7 of 29 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 22 of 29 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 4 of 29 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 3 of 29 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Paeniglutamicibacter middenicola sp. nov., isolated from midden soil waste |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Sakdapetsiri,C. Ngaemthao,W. Suriyachadkun,C. Pinyakong,O. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (17-JUN-2021) Microbiology, Chulalongkorn University, 254 Phayathai Rd., Bangkok, Bangkok 10330, Thailand |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Sakdapetsiri,C. Ngaemthao,W. Suriyachadkun,C. Pinyakong,O. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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