| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004570 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Kitasatospora humi strain RB6PN24, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Kitasatospora humi |
| アクセッション番号またはID | NZ_JAJJPA000000000 |
| コメント | Kitasatospora humi strain RB6PN24, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_JAJJPA000000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2021-11-24 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 8094094 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | RB6PN24 |
| 分離源 | peat swamp soil |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to JAJJPA000000000.1.; The Kitasatospora humi whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_JAJJPA000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_JAJJPA010000000, and consists of sequences JAJJPA010000001-JAJJPA010000150.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from single isolate.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 2021 ; Assembly Method :: Unicycler v. 0.4.8.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 48.0x ; Sequencing Technology :: Illumina HiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 08/31/2023 17:55:18 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 7,359 ; CDSs (total) :: 7,272 ; Genes (coding) :: 7,108 ; CDSs (with protein) :: 7,108 ; Genes (RNA) :: 87 ; rRNAs :: 1, 2 (16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1 (16S) ; partial rRNAs :: 2 (23S) ; tRNAs :: 81 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 164 ; CDSs (without protein) :: 164 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 164 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 45 of 164 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 137 of 164 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 6 of 164 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 22 of 164 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Draft genome sequence of Kitasatospora sp. RB6PN24 isolated from peat swamp forest in Thailand |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Duangmal,K. Klaysubun,C. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (16-NOV-2021) Microbiology, Kasetsart University, 50 Ngam Wong Wan, Bangkok 10900, Thailand |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Duangmal,K. Klaysubun,C. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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