| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004572
|
|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Fructobacillus papyriferae strain M1-13, whole genome shotgun sequencing project）
|
| 生物種名 |
Fructobacillus papyriferae
|
| アクセッション番号またはID |
NZ_JAJNCC000000000
|
| コメント |
Fructobacillus papyriferae strain M1-13, whole genome shotgun sequencing project.
|
| ゲノム配列のバージョン |
NZ_JAJNCC000000000.1
|
| 登録日または更新日 |
2021-12-03
|
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
1264088
|
| 形態 |
linear
|
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
|
| strain |
M1-13
|
| 分離源 |
paper mulberry
|
| plasmid |
|
| 備考 |
|
| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to JAJNCC000000000.1.; The Fructobacillus papyriferae whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_JAJNCC000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_JAJNCC010000000, and consists of sequences JAJNCC010000001-JAJNCC010000008.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPAdes v. 3.15.3 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 615.0x ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Name :: GCF_021026255.1-RS_2024_03_27 ; Annotation Date :: 03/27/2024 21:48:52 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.7 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 1,271 ; CDSs (total) :: 1,217 ; Genes (coding) :: 1,208 ; CDSs (with protein) :: 1,208 ; Genes (RNA) :: 54 ; rRNAs :: 2, 1, 2 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2, 1 (5S, 16S) ; partial rRNAs :: 2 (23S) ; tRNAs :: 46 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 9 ; CDSs (without protein) :: 9 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 9 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 0 of 9 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 9 of 9 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 0 of 9 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
|
| 参照 |
1
|
| タイトル |
Fructobacillus papyriferae sp. nov., Fructobacillus papyrifericola sp. nov., Fructobacillus broussonetiae sp. nov., and Fructobacillus parabroussonetiae sp. nov., isolated from paper mulberry of Taiwan
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Lin,S.-T.
|
| PubMed |
|
| 参照 |
2
|
| タイトル |
Direct Submission
|
| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (25-NOV-2021) Bioresource Collection and Research Centrer, Food Industry Research and Development Institute, 331, Shih-Pin Rd., Hsinchu City 300, Taiwan
|
| 出版年月 |
|
| 巻・号・ページ |
|
| 著者 |
Lin,S.-T.
|
| PubMed |
|
| 関連情報 |
このデータにリンクしている情報 |
