| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004597 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Streptococcus sp. ST2, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Streptococcus sp. ST2 |
| アクセッション番号またはID | NZ_JARQVW000000000 |
| コメント | Streptococcus sp. ST2, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_JARQVW000000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-04-06 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 2155906 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | ST2 |
| 分離源 | blood |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to JARQVW000000000.1.; The Streptococcus sp. ST2 whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_JARQVW000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_JARQVW010000000, and consists of sequences JARQVW010000001-JARQVW010000025.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; Bacteria and source DNA available from NBRC 115928.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SPAdes v. 3.10.1 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: No ; Genome Coverage :: 213.0x ; Sequencing Technology :: Illumina MiSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 04/05/2023 12:44:04 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.5 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 2,071 ; CDSs (total) :: 2,021 ; Genes (coding) :: 1,998 ; CDSs (with protein) :: 1,998 ; Genes (RNA) :: 50 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 43 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 23 ; CDSs (without protein) :: 23 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 23 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 6 of 23 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 20 of 23 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 3 of 23 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 5 of 23 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Streptococcus taoyuanensis sp. nov., a novel species isolated from the patient with bacteremia |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,Y.-S. Lee,C.-Y. Chan,C.-K. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (24-MAR-2023) Department of Biotechnology, Ming Chuan University, De-Ming Rd., Guishan Dist., Taoyuan City 333, Taiwan |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Chen,Y.-S. Lee,C.-Y. Chan,C.-K. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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