| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004599 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Cerasicoccus maritimus strain NBRC 105382, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Cerasicoccus maritimus |
| アクセッション番号またはID | NZ_JAVDPD000000000 |
| コメント | Cerasicoccus maritimus strain NBRC 105382, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_JAVDPD000000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2023-09-11 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 4810633 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | NBRC 105382 |
| 分離源 | seawater |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to JAVDPD000000000.1.; The Cerasicoccus maritimus whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_JAVDPD000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_JAVDPD010000000, and consists of sequences JAVDPD010000001-JAVDPD010000066.; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: A5-MiSeq v. 2014 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 282.0x ; Sequencing Technology :: Illumina NovaSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 09/09/2023 07:01:36 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 4,035 ; CDSs (total) :: 3,972 ; Genes (coding) :: 3,943 ; CDSs (with protein) :: 3,943 ; Genes (RNA) :: 63 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 56 ; ncRNAs :: 4 ; Pseudo Genes (total) :: 29 ; CDSs (without protein) :: 29 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 29 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 3 of 29 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 27 of 29 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 4 of 29 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 4 of 29 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (16-AUG-2023) Institute of Marine Migrobes and Ecosphere, Xiamen University, Zhou Long Quan Building Xiamen University Xiang'an Campus, No. 4221 Xiang'an South Road, Xiamen 361102, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Qiu,X. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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