| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
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解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004604
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Microbacterium schleiferi strain NBRC 15075, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Microbacterium schleiferi
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| アクセッション番号またはID |
NZ_JAZHOV000000000
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| コメント |
Microbacterium schleiferi strain NBRC 15075, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_JAZHOV000000000.1
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| 登録日または更新日 |
2024-02-13
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
3063202
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
NBRC 15075
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| 分離源 |
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to JAZHOV000000000.1.; The Microbacterium schleiferi whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_JAZHOV000000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_JAZHOV010000000, and consists of sequences JAZHOV010000001-JAZHOV010000019.; The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). Information about PGAP can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Method :: SOAP denovo v. 2.04 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 98.9x ; Sequencing Technology :: Illumina ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 02/12/2024 10:37:53 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 2,949 ; CDSs (total) :: 2,896 ; Genes (coding) :: 2,861 ; CDSs (with protein) :: 2,861 ; Genes (RNA) :: 53 ; rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 1, 1, 1 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 47 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 35 ; CDSs (without protein) :: 35 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 35 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 7 of 35 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 30 of 35 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 2 of 35 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 4 of 35 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
the genome sequence of strain Microbacterium schleiferi NBRC 15075
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Ding,Y. Zhang,G.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (30-JAN-2024) KEY LABORATORY OF MARINE BIOGENETIC RESOURCES, Third Institute of Oceanography(TIO) of the Ministry of Natural Resources, No. 184, Daxue Road, Siming District, Xiamen, Fujian 361001, China
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Ding,Y. Zhang,G.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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