| データタイトル | 分類 | 菌株番号 | 基準株 | データID |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID |
ANGE0000000004607
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|---|---|
| データタイトル |
ゲノム（RefSeq:Legionella septentrionalis strain km711, whole genome shotgun sequencing project）
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| 生物種名 |
Legionella septentrionalis
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| アクセッション番号またはID |
NZ_RZGS00000000
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| コメント |
Legionella septentrionalis strain km711, whole genome shotgun sequencing project.
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| ゲノム配列のバージョン |
NZ_RZGS00000000.1
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| 登録日または更新日 |
2019-01-06
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| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） |
2660547
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| 形態 |
linear
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| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 |
genomic DNA
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| strain |
km711
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| 分離源 |
river water
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| plasmid |
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| 備考 |
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| 菌株へのコメント |
REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to RZGS00000000.1.; The Legionella septentrionalis whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_RZGS00000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_RZGS01000000, and consists of sequences RZGS01000001-RZGS01000085.; Annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (released 2013). Information about the Pipeline can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 06-DEC-2018 ; Assembly Method :: SPAdes v. v3.12.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 370x ; Sequencing Technology :: Illumina NextSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 01/17/2024 12:04:13 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 2,471 ; CDSs (total) :: 2,421 ; Genes (coding) :: 2,365 ; CDSs (with protein) :: 2,365 ; Genes (RNA) :: 50 ; rRNAs :: 3, 2, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2 (5S) ; partial rRNAs :: 1, 2, 3 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 39 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 56 ; CDSs (without protein) :: 56 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 56 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 24 of 56 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 41 of 56 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 3 of 56 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 56 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END##
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| 参照 |
1
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| タイトル |
Legionella sp,whole genome shotgun sequence
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| 雑誌名/登録機関名 |
Unpublished
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Wu,H.
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| PubMed |
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| 参照 |
2
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| タイトル |
Direct Submission
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| 雑誌名/登録機関名 |
Submitted (25-DEC-2018) Science & Research, kingMed Center for Clinical Laborary, No. 10 Luoxuan 3rd Road, Guangzhou International Biotech Island, Guangzhou, Guangdong 510005, China
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| 出版年月 |
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| 巻・号・ページ |
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| 著者 |
Wu,H.
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| PubMed |
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| 関連情報 |
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