| データタイトル | 他機関での菌株情報 | 遺伝子型 | 復元液 | データID | 菌株番号 | カタログURL | 生物種名 | 生物種名（著者名含） | 基準株 | 来歴 | 分離源 | 分類 | 培養温度 | 培養培地 | 親株（変異株の場合） | 付加情報 |
|---|
解析情報 ゲノム
| データID | ANGE0000000004607 |
|---|---|
| データタイトル | ゲノム（RefSeq:Legionella septentrionalis strain km711, whole genome shotgun sequencing project） |
| 生物種名 | Legionella septentrionalis |
| アクセッション番号またはID | NZ_RZGS00000000 |
| コメント | Legionella septentrionalis strain km711, whole genome shotgun sequencing project. |
| ゲノム配列のバージョン | NZ_RZGS00000000.1 |
| 登録日または更新日 | 2019-01-06 |
| 配列取得用URL | |
| 配列ファイルダウンロード | |
| 配列長（bp）または配列数（rc） | 2660547 |
| 形態 | linear |
| BioProject | |
| BioSample | |
| 配列の種類 | genomic DNA |
| strain | km711 |
| 分離源 | river water |
| plasmid | |
| 備考 | |
| 菌株へのコメント | REFSEQ INFORMATION: The reference sequence is identical to RZGS00000000.1.; The Legionella septentrionalis whole genome shotgun (WGS) project has the project accession NZ_RZGS00000000. This version of the project (01) has the accession number NZ_RZGS01000000, and consists of sequences RZGS01000001-RZGS01000085.; Annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (released 2013). Information about the Pipeline can be found here: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/; ##Genome-Assembly-Data-START## ; Assembly Date :: 06-DEC-2018 ; Assembly Method :: SPAdes v. v3.12.0 ; Genome Representation :: Full ; Expected Final Version :: Yes ; Genome Coverage :: 370x ; Sequencing Technology :: Illumina NextSeq ; ##Genome-Assembly-Data-END##; ##Genome-Annotation-Data-START## ; Annotation Provider :: NCBI RefSeq ; Annotation Date :: 01/17/2024 12:04:13 ; Annotation Pipeline :: NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) ; Annotation Method :: Best-placed reference protein set; GeneMarkS-2+ ; Annotation Software revision :: 6.6 ; Features Annotated :: Gene; CDS; rRNA; tRNA; ncRNA ; Genes (total) :: 2,471 ; CDSs (total) :: 2,421 ; Genes (coding) :: 2,365 ; CDSs (with protein) :: 2,365 ; Genes (RNA) :: 50 ; rRNAs :: 3, 2, 3 (5S, 16S, 23S) ; complete rRNAs :: 2 (5S) ; partial rRNAs :: 1, 2, 3 (5S, 16S, 23S) ; tRNAs :: 39 ; ncRNAs :: 3 ; Pseudo Genes (total) :: 56 ; CDSs (without protein) :: 56 ; Pseudo Genes (ambiguous residues) :: 0 of 56 ; Pseudo Genes (frameshifted) :: 24 of 56 ; Pseudo Genes (incomplete) :: 41 of 56 ; Pseudo Genes (internal stop) :: 3 of 56 ; Pseudo Genes (multiple problems) :: 12 of 56 ; CRISPR Arrays :: 1 ; ##Genome-Annotation-Data-END## |
| 参照 | 1 |
| タイトル | Legionella sp,whole genome shotgun sequence |
| 雑誌名/登録機関名 | Unpublished |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Wu,H. |
| PubMed | |
| 参照 | 2 |
| タイトル | Direct Submission |
| 雑誌名/登録機関名 | Submitted (25-DEC-2018) Science & Research, kingMed Center for Clinical Laborary, No. 10 Luoxuan 3rd Road, Guangzhou International Biotech Island, Guangzhou, Guangdong 510005, China |
| 出版年月 | |
| 巻・号・ページ | |
| 著者 | Wu,H. |
| PubMed | |
| 関連情報 |
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